1. Introduction
Les bactéries font partie du domaine
des procaryotes. Contrairement aux eucaryotes, elles ne possèdent
pas de noyeau ni d'organites (mitochondries, chloroplastes...).
Elles ne possèdent pas non plus de réticulum
endoplasmique ni d'appareil de Golgi.
Les bactéries se présentent
sous de nombreuses formes : sphériques (coques), allongées
ou en bâtonnets (bacilles), des formes plus ou moins
spiralées.
2. Classification fonctionnelle des bactéries
des digesteurs
Dans les digesteurs anaérobies on
classe les bactéries selon leur fonctions:
Le tableau ci dessous donne les principales
bactéries hydrolysantes selon leur substrat:
Bactéries
hydrolysantes dans les digesteurs anaérobies |
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Cellulolytiques |
Cellulodextrino
-lytique |
Hémicellulo-
lytiques |
Xylodextrino
-lytiques |
Pectino- lytiques |
Amylo- lytiques |
Amylodextrino -lytiques |
Protéo-
lytiques |
Peptido- lytiques |
Lipolytiques |
Anaerovibrio lipolytica |
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Butyrivibrio fibrisolvens |
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Clostridium aerotolerans |
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Clostridium aminophilum |
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Clostridium longisporum |
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Clostridium polysaccharolyticum |
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Clostridium sticklandii |
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Eubacterium cellulosolvens |
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Eubacterium ruminantium |
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Eubacterium limosum |
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Fibrobacter succinogenes |
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Lachnospira multipara |
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Mitsuokella jalaludinii |
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Mitsuokella multiacidus |
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Prevotella albensis |
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Prevotella brevis |
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Prevotella bryantii |
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Prevotella ruminicola |
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Ruminobacter amylophilus |
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Ruminococcus albus |
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Ruminococcus bromii |
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Ruminococcus flavefaciens |
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Selenomonas ruminantium |
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Streptococcus bovis |
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Succinimonas amylolytica |
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Succinivibrio dextrinosolvens |
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Treponema bryantii |
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Treponema saccharophylum |
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Le tableau suivant reprend les bactéries
fermentatives selon leur substrat:
Bactéries
fermentatives acidogènes dans les digesteurs
anaérobies |
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Cellobiose |
Maltose |
Saccharose |
Glucose |
Galactose |
Fructose |
Pentoses |
Acides uroniques |
Acides aminés |
Acides organiques |
Glycérol |
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Lactate |
Malate |
Fumarate |
Succinate |
Oxalate |
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Acidaminococcus fermentans |
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Allisonella histaminiformans |
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Anaerovibrio lipolytica |
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Butyrivibrio fibrisolvens |
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Clostridium aerotolerans |
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Clostridium aminophilum |
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Clostridium longisporum |
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Clostridium polysaccharolyticum |
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Clostridium sticklandii |
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Eubacterium cellulosolvens |
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Eubacterium ruminantium |
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Eubacterium limosum |
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Fibrobacter succinogenes |
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Lachnobacterium bovis |
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Lachnospira multipara |
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Mannheimia succiniproducens |
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Megasphaera elsdenii |
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Mitsuokella jalaludinii |
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Oxalobacter formigenes |
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Peptostreptococcus anaerobius |
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Prevotella albensis |
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Prevotella brevis |
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Prevotella bryantii |
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Prevotella ruminicola |
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Propionibacterium sp. |
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Ruminobacter amylophilus |
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Ruminococcus albus |
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Ruminococcus flavefaciens |
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Schwartzia succinivorans |
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Selenomonas ruminantium |
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Streptococcus bovis |
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Succinimonas amylolytica |
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Succiniclasticum ruminis |
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x |
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Succinivibrio dextrinosolvens |
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x |
x |
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x |
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x |
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Synergistes jonesii |
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Veillonella alcalescens |
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x |
|
x |
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Wolinella succinogenes |
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x |
x |
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Le tableau suivant résume les principales
bactéries acétogènes et sulfato-réductrices:
Bactéries
fermentatives acétogènes et sulfato-réductrices
dans les digesteurs anaérobies |
|
acétogène |
Sulfato-réductrice |
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|
Acetitomaculum ruminis |
x |
|
Eubacterium limosum |
x |
|
Eubacterium oxidoreducens |
x |
|
Peptostreptococcus productus |
x |
|
Ruminococcus schinkii |
x |
|
Desulfotomaculum ruminis |
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x |
Desulfovibrio desulfuricans |
|
x |
Desulfovibrio sp. |
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x |
Syntrophococcus sucromutans |
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x |
Le tableau suivant classe les bactéries
en fonction de leur principaux métabolites: